L'institut Baguer dispose d'une équipe médicale composée:

• d'un médecin spécialisé en oto-rhino-laryngologie (O.R.L.),
• de pédiatres

L'équipe médicale assure :

• les consultations d'admission,
• deux consultations de coordination thérapeutique en cours d'année,
• tout examen médical en urgence suite à un incident survenu dans l'établissement..

L'équipe médicale ne se substitue ni au médecin traitant ni aux différents spécialistes qui suivent l'enfant ou l'adolescent.

Les médecins participent aux réunions pluridisciplinaires et coordonnent les projets thérapeutiques.